| Herramienta | Dirección de Internet | Descripción |
| GeneFisher | http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/genefisher/ | Sitio WEB para el diseño de iniciadores para PCR. Permite derivar iniciadores a partir de alineamientos múltiples de secuencias. |
| Primer 3 | http://frodo.wi.mit.edu/cgi-bin/primer3/primer3_www.cgi | Sitio WEB para el diseño de iniciadores para PCR. |
| CODEHOP | http://blocks.fhcrc.org/codehop.html | Programa para del diseño de iniciadores degenerados híbridos consenso. |
| PDA | http://dbb.nhri.org.tw/primer/ | Asistente para el diseño de iniciadores de PCR. |
| REBASE | http://www.mrc-lmb.cam.ac.uk/genomes/madanm/pres/rebase1.htm | Base de datos de enzimas de restricción |
| Webcutter | http://www.firstmarket.com/cutter/cut2.html | Programa para la localización de sitos de corte de enzimas de restricción. |